A jelenleg a világbajnokságon játszó csatár a következő idényt minden bizonnyal új klubban fogja elkezdeni, miután az elmúlt hónapokban többször is összekülönbözött Sir Alex Fergusonnal, a MU menedzserével, aki már jelezte neki, hogy a továbbiakban nem számít a játékára.

Karl-Heinz Rummenigge, a Bayern München elnöke elismerte, hogy felvették a kapcsolatot az angol klubbal, amelytől kértek egy árajánlatot. Van Nistelrooy az idény végén többször is a kispadon találta magát, miután Luis Saha felgyógyult sérüléséből.